近年來，節省能源、安全可靠、效果好、成本低的包裝食品殺菌技術相繼得到開發和應用，大大促進了包裝食品的生產與發展。

輻照殺菌技術：是利用放射線同位素鈷60、銫157產生的γ-射線或低能加速器放射出的β-射線對包裝食品進行輻照處理。加拿大、以色列、法國、日本等國家普遍使用放射物質鈷60，它放射出的強力γ射線可徹底摧毀細菌的遺傳因子，徹底破壞他們的生理活性，使用高劑量時幾乎可以消滅任何細菌。

輻照完全殺菌：將密封包裝后的食品以2500～5000千拉德輻照，能使所有損壞食品的致病性微生物死滅，從而達到商品消毒目的。輻照前可在食品中加入食鹽和三磷酸鈉等，能減少食品的水分損失，又能增強射線對細菌的殺傷能力。經輻照完全殺菌法處理后的牛肉、雞肉、火腿、豬肉、香腸、魚蝦等在常溫(21℃～38℃)下能貯藏2年以上，可保持色香味佳。

輻照消毒殺菌：劑量100～1000千拉德，可有效地限制有損大眾健康的生物及致敗性微生物生長，能有效清除對高蛋白質食品如肉類、乳制品、蛋制品危害極大的沙門氏菌，用50萬拉德照射，就能使之成億倍減少，也能殺死冷凍食品深處的沙門氏菌。現全世界已有20多個國家批準應用輻照殺菌的食品供人類食用，如雞肉、豬肉、鮮魚、蘑菇、香料、土豆、大米、洋蔥、小麥等。輻照食品安全可靠，經世界各國40多年實踐證明，輻照食品從未發現有放射性物質殘留，能保持原有質量和色香味。在美國，輻照食品已帶上太空，宇航員食用后證明對身體也無害。輻照食品的優點是保藏期長，照射一次可保鮮數年，既殺死細菌，又抑制與延緩食品本身的新陳代謝，消除了食品變質根源。輻照殺菌可節省大量能量，任何食物用輻照法殺菌后僅采用普通包裝便可貯藏，省去大量制罐、冷凍冷藏等材料以及能量，以輻照保藏已可代替部分冰箱。

紫外線照射：紫外線照射即利用紫外線殺傷目標微生物的DNA，使之發生化學變化形成嘧啶二聚物，以破壞遺傳因子而失去繁殖能力或死亡，殺菌效果以250～260nm最強。國外研制的強力紫外燈，照射強度達200mw/cm2，為高性能紫外線裝置，對包裝材料殺菌安全有效。

固體表面殺菌器：將包裝好的食品通過傳送帶，送入照射軌道內，用殺菌燈滅菌處理，然后用傳送帶送出。適用于塑料薄膜包裝的食品，要求包裝材料用光線穿透率好的聚乙烯或聚丙烯塑料薄膜。

液體殺菌器：可分兩種，有外部照射的外部照射式和讓水及液體從內部流過的內部照射式。殺菌效果可以從初始濃度經照射后達到零。

紫外線殺菌：紫外線殺菌不需或只需少量添加殺菌劑和防腐劑，比加熱處理及過濾殺菌法省能、成本低，維護簡便，使用安全可靠，殺菌后不損害食品香味及光澤等優點，應用較廣泛。美國先后開發了系列產品，放射量比過去大數十倍的紫外燈已經實用化，已可逐漸用于透射。紫外線殺菌如配合加熱、過氧化氫、熱檸檬酸溶液、乙醇、超聲波等處理方法，效果則更好。

微波殺菌：微波殺菌就是用微波使水分子發生振動，利用分子產生的摩擦熱進行殺菌。適用于導熱不良的食品和因加熱而易降低品質的食品。對于采用塑料包裝材料的食品，能在包裝原狀下，短時間內從食品中心加熱殺菌，還能防止二次污染。微波殺菌只適用于霉菌、酵母菌、大腸桿菌等不耐熱的微生物，但對附著在食品背面，水分含量低的食品和無水分、誘導小的塑料或玻璃上的微生物，因溫度不能充分提高，效果不顯著。

微波加熱法：微波加熱法有烤爐或導管式兩種，后者應用于處理液體，液體流過斜貫于導管的玻璃管中被加熱。

無菌包裝技術：無菌包裝技術是經過殺菌、冷卻的無菌食品在無菌狀態下，充填到預先殺菌過的容器中，經過密封而能長期貯藏的包裝技術。近十年來，無菌裝罐由流體發展到固體，包裝材料由金屬罐向包裝材料推移.無菌包裝技術在歐美、日本等國迅速發展，廣泛應用于牛乳為主的乳制品，果汁、布丁、肉類等加工食品，蔬菜汁、肉湯、清涼飲料和咖啡飲料、豆漿等領域。

無菌包裝優點很多：制品風味、組織色澤變化及營養成分損失和蛋白質熱變性都較少，無菌包裝的肉制品沒有脂肪析出和肉汁分離現象，能更好保持原口感和風味;無菌包裝的果汁易于保管，味道新鮮，實用方便。無菌包裝對包裝容器強度要求低，材料可用紙板、塑料、鋁等。特別是紙容器成本低，重量輕，無金屬溶出現象，用后可棄，處理簡單，美國飲用牛乳70%都用紙包裝。無菌包裝還有節約能源、適合大批量生產等優點。

無菌包裝系統包括食品的殺菌和無菌充填密封兩大部分。食品殺菌通常采用高溫短時殺菌工藝(HTST法)和超高溫瞬間殺菌(UHT)，用耐熱性塑料薄膜與鋁箔組成的復合薄膜，更能大幅度縮短殺菌時間。無菌充填包裝用的軟包裝材料殺菌一般采取紫外線殺菌、放射線殺菌及過氧化氫溶液浸漬、噴霧、熱風干燥，或用氣體殺菌劑殺菌。

國際上典型的無菌包裝裝置有美國Dole公司的無菌裝罐，用于金屬罐包裝的流體、膠體和含有固形物的食品，如多種布丁、煉乳、醬狀食品、酸奶鮮奶等。無菌裝罐設備由空罐殺菌、充填、罐蓋殺菌、封罐四部分構成，空罐210℃～220℃殺菌45秒后進入無菌室時，從其下部噴射無菌水使空罐冷卻，一般采用槽流式裝罐機連續裝罐。日本的MM無菌充填裝置是將苯乙烯塑料薄膜用雙氧水殺菌后，加熱成形膜沖壓成環狀容器，自動定量充填，送出經雙氧水殺菌的蓋用鋁箔，用密封膜封口，落料膜切斷，用于布丁、果醬、冰淇淋、牛乳、果汁等無菌充填。

在無菌包裝過程中，除對包裝用材料、包裝食品消毒殺菌外，對車間、工作機械、空氣，整個操作都需清潔無菌，徹底實現微生物控制的生產管理和流通管理。

目前，還開發了更適用的新殺菌技術。如使罐頭在高速旋轉中用氣體火焰直接加熱的火焰滅菌法，可加速熱傳導，防止受熱不均勻，應用于罐頭食品與蒸煮袋食品效果好;還有包裝材料不必殺菌、食品處理設備簡單的液體食品殺菌的獨特方法;利用過熱蒸汽對干燥食品進行氣流式殺菌法，不會象飽和蒸汽使原料受潮，對谷物及粉粒狀食品效果更好。