RFID的大規模應用過程中也存在著諸多問題。居高不下的成本，是RFID實現規模應用的最大障礙；技術上某些驗證機制的缺乏帶來隱私泄漏的擔憂；技術標準之爭，也是RFID的市場化進程受阻的一個重要原因。

　　價格是RFID走向大規模市場應用的最大障礙。RFID標簽的成本一直居高不下，目前一個RFID標簽的價格大概在25到30美分左右。這如果是對于集裝箱或者汽車、冰箱之類的大宗貨物來說，當然算不上什么；但如果是相對于小宗商品來講，這一價格必然會遭到成本上的質疑。雖然Alien公司宣稱，標簽的價格會隨著訂單的增加、生產工藝的提高逐漸下降的。只要年生產量在100億個以上，單個標簽的成本就可以降到10美分甚至更低。但對大多數企業來說，單位成本需要降至3美分或更少才有可能將標簽應用于單件包裝消費品；另一個方面，布置RFID其他相關設備，如RF信號發射機、信號接收機、編程器、天線等也需要一筆巨大的投入。

　　RFID在技術上也有一定的缺陷。這表現在RFID標簽無法對閱讀器進行身份驗證。RFID標簽一旦接近RF掃描器，就會無條件自動發出信號，無法辨別其掃描器是否合法。這意味著如果有人攜帶一個RF掃描器上街，那么路上行人購物袋里的東西將會“一覽無遺”，這將會帶來極大的個人隱私保護問題。不過，這一擔憂隨著眾多軟件巨頭的加盟已經有了較為妥善的解決方案。有報道稱，日本印刷、NTT和Sun三家公司已經成功地開發出具有隱私保護功能的無線IC標簽系統，其原理是在標簽中嵌入加密ID，即便有人讀取到ID，也不會知道是什么商品。

　　另外，是統一的技術標準帶來的擔憂。目前RFID存在兩個技術標準陣營，MITAuto-IDCenter與日本的UbiquitousIDCenter分別提出各自不同的基礎協議。而這兩大陣營中，都有不同的廠商支持。采取何種標準，勢必會影響各個廠商的市場份額，進而影響產業鏈的積極互動合作。在RFID的規模應用中，如何協調各個廠商的利益，如何將分裂的“各路諸侯”納入到統一的技術規范中，這恐怕要比解決單純的技術規范問題復雜得多。

        市場調研機構ABI公司最新市場研究報告顯示，RFID的發展前景良好，未來五年將穩步增長。ABI公司市場主任MichaelLiard表示：“我們預期2014年RFID市場總體會超過82.5億美元，用于汽車immobilization(汽車防盜等)約74.6億美元。這意味著未來五年中年復合增長率為14%，而今年RFID市場也將達到44.7億美元。”

　　報告顯示，RFID"現代化"應用的增長速度將比"傳統"的應用快。"傳統"的應用包括門禁管理、汽車immobilization、電子收費等，今天約占總市場的61%。在2010到2014年期間，這些應用的年復合增長率預計為6%。與之相比，這些"現代化"的應用，包括動物識別、資產管理、行李處理、貨物跟蹤與安全、POS無接觸支付、RTLS、供應鏈管理和售票等，預計同期約增長19%。

　　在RFID應用中，汽車immobilization是RFID最大的應用項目，增長率低，對總的市場有影響，所以在審視市場發展趨勢時常將其除外。

　　Liard說："RFID市場各部門的發展是不均衡的。到2014年，增長率最高的將是RTLS(實時定位系統)、行李處理、動物識別和服裝、零售單件貼標簽。"

　　其他主要的機會有電子車輛登記、繼續推廣的電子身份識別和電子政府證件(包括健康卡)，以及繼續推廣的圖書館系統。還可以看到增長的有：繼續緩慢增長的CPG零售供應鏈管理和各種撬動RFID技術的資產管理，包括專業無源UHF標簽。